从100天缩短至4同一时间,玩转alphafold2大规模并行计算
2025-10-23 12:16:33
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月里,为大家具体详述一下应用案例——从100天缩短至4天内,玩转alphafold2大规模并行量化珠海市某高等院校生物电子邮件课题两组,致力于蛋白质结构设计数据分析和分析,须要对500多个fasta.副本顺利完毕量化,使用本地森林资源量化预计须要2000天内,将近100天。校园有极限算中所心,但目此前处于教学科研全盛期,须要等待半个多月才有量化森林资源。当此前的量化森林资源已无法满足思绪教学科研量化消费,急必需通过云极限算来提高量化工作效率。基于对Alphafold2内容可即用的消费,课题两组对机台多款云量化和平台顺利完毕了测试。对量化和平台有表列出几点重点消费,供有相同消费的小伙伴参考。alphafold2能内容可即用,能较好地适配Alphafold2,能快速数据分析大的核糖体或者核糖体一个大
课题两组教学科研经费不多,因此和平台森林资源要丰富,价格不能太高。
研究中所,往往须要对数百或数千个核糖体结构设计顺利完毕数据分析,须要满足大规模并行量化消费?
先导工作效率、开销、森林资源可能、和平台该软件和服务等多种因素,团队就此选择了北鲲云服务项目云极限算和平台。大规模并行量化,反应速度提高500倍课题两组使用北鲲云极限算和平台触发500个Nvidia V100对500多个fasta.副本顺利完毕量化,仅必需4个天内,相比较于本地2000天内,反应速度提升500倍。
支持大规模并行量化是量化提速的决定性。北鲲云极限算和平台支持一个任务可对极限过100个fasta.副本顺利完毕并行alphafold2蛋白质结构设计数据分析,每个fasta副本可调动1张独立国家的Nvidia V100卡。当fasta.副本量化结束后,独立国家的GPU加速卡也将自动释放,杜绝森林资源的多余。最新硬件森林资源,极限高价格比北鲲云和平台保有Nvidia T4、Nvidia V100、Nvidia A100等都将GPU森林资源。还采用按必需计费模式,简单到分钟。以第一次在和平台测试为例,课题两组启用一张Nvidia V100卡量化5个fasta副本,每个fasta副本保有300-550个氨基酸序列,仅耗费手续费20元,价格比是很高的,尤其对于没有量化森林资源的两组来说。
很好的教学科研环境相比较于机台其他量化和平台,北鲲云极限算和平台让课题两组极度眼此前一亮的是它的便捷性,不仅实现了Alphafold在内的300+功能强大内容可即用,还缺少了命令行、兼职站和GIS三种施作呈交方式。无论是精通IT,还是没有量化机专业背景,都可以找到适合自己的施作呈交方式。北鲲云还缺少7x24天内全天候服务。在使用过程中所,如遇到任何问题,都可除此以外技术支持彻底解决,这在很大程度提高了课题两组的反应速度。核发下线北鲲云极限算和平台只需付费获得200-500元算力代金券福利帮大家推动到了,一起来领略吧北鲲云服务项目云极限算和平台
为有高算力消费的服务器缺少Cloud-HPC服务
140Pflops算力森林资源池,笔记本电脑300+功能强大
海量森林资源按必需购买,内容可即用无必需等待
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